Η ιστορία της Σκιάθου, είναι βαθιά ριζωμένη στους αιώνες και
η απαρχή της βρίσκεται στα προϊστορικά χρόνια. Η ομορφιά
του περιβάλλοντος, το ασφαλές και ευρύχωρο λιμάνι που το
προστατεύουν τέσσερα νησάκια καταπράσινα, η πλούσια γη
της και ο θαλάσσιος πλούτος της, την έκαναν ελκυστικό πόλο
εγκατάστασης για τις μετακινούμενες κατά την προϊστορική
περίοδο φυλές. Αποτέλεσε σταθμό για τους Αργοναύτες στο
ταξίδι τους για την Κολχίδα, καθώς και για τον ελληνικό στόλο
που με επικεφαλής τον Αγαμέμνονα εκστράτευσε εναντίον
της Τροίας.
Σύμφωνα με όσα γράφονται στην "Περιήγησιν" του Εκαταίου του Μιλήσιου, το νησί κατά τους προϊστορικούς χρόνους, κατοικήθηκε από τους Πελασγούς, λαό προελληνικό που κατέβηκε από την Θράκη και έχτισε τον παλαιό οχυρωμένο της οικισμό ονόματι Παλαισκιάθο στο ύψωμα της «Κεφάλας» (στην περιοχή του σημερινού Ξάνεμου) όπου το Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας πραγματοποιεί ανασκαφές από το 2009 (http://www.ha.uth.gr/index.php?page=arch-research-skiathos) . Δεν αποκλείται όμως, πριν την εγκατάσταση των Πελασγών στη Σκιάθο, το νησί να είχε κατοικηθεί από Κάρες, αρχαιότατο Μικρασιάτικο λαό, που ήρθαν και εγκαταστάθηκαν σε πολλά ελληνικά νησιά στα παλιά εκείνα χρόνια, όπως μας λέει ο Θουκιδίδης.
Μετά κατοικήθηκε πιθανότατα από τους Κρήτες που γνωρίζουμε ότι είχαν καταλάβει την γειτονική Πεπάρηθο (σημερινή Σκόπελος) αλλά και τη Σκύρο, και που έφεραν στο νησί την καλλιέργεια της ελιάς και του αμπελιού. Στην υπόθεση αυτή συνηγορεί και το γεγονός ότι ένα από τα λατρευτικά ονόματα το θεού Διόνυσου ο οποίος λατρεύοταν στα νησιά που κατέλαβαν οι Κρήτες ήταν το "Σκιάνθιος", επίθετο που μοιάζει με το όνομα του νησιού. οι οποίοι είχαν ήδη καταλάβει τη γειτονική Σκόπελο αλλά και τη Σκύρο.